骨髓增生异常综合征可出现一系列的并发症风险，当病症发生的同时，如果治疗不当，控制不住，可进一步促进病情的恶化发展。
关于骨髓增生异常综合征的并发症有哪些：
一、合并骨髓纤维化
近50%的MDS患者骨髓中有轻～中度网状纤维增多，其中10%～15%的患者有明显纤维化。与原发性骨髓纤维化症不同的是，MDS合并骨髓纤维化者外周血常全血细胞减少，异形和破碎红细胞较少见;骨髓常示明显三系发育异常，胶原纤维形成十分少见。而且常无肝脾肿大。MDS合并骨髓纤维化可见于各个亚型，有学者认为是提示不良预后的因素之一。另有一种罕见的情况，称为急性骨髓增生异常伴有骨髓纤维化。
二、合并骨髓增生低下
约10%～15%的MDS患者在诊断时骨髓涂片示有核细胞明显减少，骨髓组织切片中造血组织面积缩小(60岁以下患者造血组织面积30%，60岁以上患者20%)。有一些学者将这种情况称为增生低下型MDS，并认为是MDS的一个特殊亚型。事实上这种情况很难与再生障碍性贫血鉴别。
三、并发免疫性疾病
近年来关于MDS并发免疫性疾病的报道日渐增多。免疫性疾病可发生于MDS诊断之前、之后或同时。已报道并发于MDS的免疫性疾病有皮肤性或系统性血管炎、风湿性骨关节炎、炎性肠病、复发性多软骨炎、急性发热性中性粒细胞性皮炎、坏死性脂膜炎、桥本甲状腺炎、干燥综合征(舍格伦综合征)、风湿性多肌痛，等等。
医者表示，免疫性疾病可并发于MDS各个亚型，但较多并发于有克隆性和复杂染色体异常者。MDS并发某些免疫性疾病(如Sweet’s综合征)时，病情常迅速恶化或在短期内转白。免疫抑制治疗对部分患者可控制病情，改善血液学异常。
四、最常见的并发症为感染
感染、发热主要是肺部感染、贫血、严重者可并发贫血性心脏病。出血主要见于皮肤、黏膜及内脏出血、关节疼痛等，急性白血病MDS中RA，RAS型演变为急性髓细胞白血病的发生率约为13%。
对于骨髓增生异常综合征的治疗，其目的是抑制异常造血以及病态造血，阻止病情恶化发展的脚步，缓解病症，提升血象，预防并发症的发生（以及病情再次复发）提高生活质量，获得好的预后，最大化的延长生存期。
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