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宏基因组序列多样性揭示薏苡黑穗病相关致病菌群
黑穗病是薏苡最严重的系统性病害之一，发病植株的茎、叶和子房正常结构被破坏、组织弯曲变形、组织内充满黑色粉状物，导致薏苡大面减产并严重影响薏苡加工品质。为了有效揭示薏苡黑穗病瘿的菌群祖成，并寻找黑穗病相关的致病菌群，为黑穗病的绿色防控提供新思路。本研究利用ITS高通量测序技术对薏苡黑穗病瘿的真菌进行检测，并以宏基因组分析方法解析了来自4个地域（贵州兴仁、贵州兴义、贵州晴隆、贵州安顺）共22个薏苡黑穗病瘿组织样品的菌群组成和群落多样性。研究结果表明，薏苡黑穗病瘿中存在多种真菌菌群，总共聚类得到条物种OTU，4个采样地域共享条物种OTU，22个样品共享6条物种OTU；所有样品总共注释得到9门、20纲、45目、90科和属。菌群多样性分析显示，不同样品的Shannon多样性指数和Simpson指数范围分别为0.～1.和0.～0.，而且4个地域的菌群多样性顺序为AS（安顺）QL（晴隆）XR（兴仁）XY（兴义）；不同样品间和地域区组之间均表现出比较明显的多样性差异，但是其菌群多样性并未表现出绝对的地理相关性。另外，通过菌群的分类解析发现，在属分类水平发现与黑穗病相关的2个近缘真菌属Sporisorium和Ustilago，其中Sporisorium为优势菌群。本研究通过对黑穗病瘿菌群的分类解析和多样性分析，有效揭示了2个与黑穗病相关的2个真菌属，可为薏苡的黑穗病的绿色防治和产量品质的提升提供理论指导。
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